Michel Desjoyeaux, cadet d'une fratrie de sept enfants, grandit dans une famille passionnée par la voile et la navigation. Son père, Henri, contribua à la fondation de l'école influente de voile Les Glénans.

Bricoleur, il s'intéresse de près à la construction de bateaux et prend peu à peu goût à la compétition en décrochant des titres.

Avant 2000, le Breton s'illustre dans 7 éditions du Solitaire du Figaro. Il remporte 2 éditions, en 1992 et 1998, et termine 4 fois sur le podium. Desjoyeaux s'est construit une réputation.

Le 9 novembre 2000, il prend le départ de son premier Vendée Globe avec l'entreprise vendéenne PRB. Après plus de 93 jours de mer, il termine devant Ellen MacArthur qui a marqué le Vendée Globe par sa fougue et sa performance inédite.

Il reprend le départ du "Vendée" 8 ans plus tard. "Le Professeur" récidive et devient le seul marin à avoir remporté deux éditions.